Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mthfd1Q922D8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mthfd1Q922D8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms