Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms