Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpm2Q91YD4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms