Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec16bQ91XT4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms