Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx11Q91WL6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms