Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Odf4Q8VI88 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Odf4Q8VI88 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf4Q8VI88 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf4Q8VI88 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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