Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms