Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thoc3Q8VE80 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thoc3Q8VE80 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms