Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms