Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms