Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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