Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms