Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms