Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApobrQ8VBT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms