Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcsapQ8QZT2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms