Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot6Q8K3P5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms