Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OptnQ8K3K8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms