Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms