Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncapd2Q8K2Z4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms