Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms