Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms