Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Trappc12Q8K2L8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Trappc12Q8K2L8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Trappc12Q8K2L8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Trappc12Q8K2L8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc12Q8K2L8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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