Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Fbxo18Q8K2I9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Fbxo18Q8K2I9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxo18Q8K2I9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms