Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms