Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh3Q8K1E6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms