Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms