Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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