Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms