Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms