Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms