Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgefQ8CHT1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms