Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms