Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms