Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Slc43a2Q8CGA3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc43a2Q8CGA3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms