Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms