Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdc34Q8CFI2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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