Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms