Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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