Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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