Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc17Q8CE13 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms