Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc9Q8CDN9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms