Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms