Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8CC96 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8CC96 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Q8CC96 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Q8CC96 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Q8CC96 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8CC96 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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