Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Usp20Q8C6M1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Usp20Q8C6M1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp20Q8C6M1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp20Q8C6M1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp20Q8C6M1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp20Q8C6M1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp20Q8C6M1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms