Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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