Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trim35Q8C006 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms