Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh12Q8BYK4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms