Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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