Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms