Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trerf1Q8BXJ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms